Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms