Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snai1Q02085 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms