Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gja5Q01231 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms