Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms