Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms