Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou1f1Q00286 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms