Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms