Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb4P99026 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms