Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited1P97769 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cited1P97769 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited1P97769 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited1P97769 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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