Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2cP97760 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2cP97760 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms