Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms