Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms