Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RptnP97347 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RptnP97347 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RptnP97347 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RptnP97347 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RptnP97347 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RptnP97347 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RptnP97347 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RptnP97347 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RptnP97347 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RptnP97347 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RptnP97347 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RptnP97347 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RptnP97347 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RptnP97347 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RptnP97347 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RptnP97347 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RptnP97347 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RptnP97347 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RptnP97347 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RptnP97347 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RptnP97347 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RptnP97347 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RptnP97347 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RptnP97347 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RptnP97347 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RptnP97347 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RptnP97347 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RptnP97347 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RptnP97347 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RptnP97347 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RptnP97347 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RptnP97347 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RptnP97347 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RptnP97347 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RptnP97347 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RptnP97347 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms