Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx3P81067 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx3P81067 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx3P81067 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx3P81067 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms