Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms