Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms