Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx4P70452 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms