Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SeboxP70368 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SeboxP70368 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SeboxP70368 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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