Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms