Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms