Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms