Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acta1P68134 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms