Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps28P62858 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps28P62858 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms