Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsnl1P62761 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vsnl1P62761 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms