Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpfP62307 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpfP62307 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms