Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms