Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2mP61082 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2mP61082 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2mP61082 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2mP61082 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2mP61082 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2mP61082 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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