Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lim2P56563 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lim2P56563 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms