Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd1P52734 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms