Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp10P52479 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp10P52479 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp10P52479 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms