Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CastP51125 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CastP51125 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CastP51125 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CastP51125 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CastP51125 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CastP51125 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CastP51125 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CastP51125 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CastP51125 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CastP51125 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CastP51125 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CastP51125 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CastP51125 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CastP51125 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CastP51125 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CastP51125 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CastP51125 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CastP51125 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CastP51125 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CastP51125 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CastP51125 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CastP51125 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CastP51125 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CastP51125 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CastP51125 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CastP51125 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CastP51125 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CastP51125 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CastP51125 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CastP51125 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CastP51125 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CastP51125 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CastP51125 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CastP51125 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CastP51125 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CastP51125 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CastP51125 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms