Protein–RNA interactions for Protein: P50538

Mxd1, Max dimerization protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mxd1P50538 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mxd1P50538 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mxd1P50538 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mxd1P50538 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mxd1P50538 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mxd1P50538 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms