Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psen1P49769 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms