Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnni3P48787 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms