Protein–RNA interactions for Protein: P48316

Gadd45a, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45aP48316 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gadd45aP48316 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gadd45aP48316 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms