Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkn1bP46414 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms