Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NodalP43021 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NodalP43021 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NodalP43021 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NodalP43021 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NodalP43021 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NodalP43021 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NodalP43021 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NodalP43021 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NodalP43021 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NodalP43021 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NodalP43021 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NodalP43021 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NodalP43021 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NodalP43021 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NodalP43021 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms