Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms