Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ThpoP40226 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ThpoP40226 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ThpoP40226 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ThpoP40226 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ThpoP40226 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms