Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtlP38585 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtlP38585 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtlP38585 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TtlP38585 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtlP38585 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtlP38585 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtlP38585 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtlP38585 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtlP38585 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtlP38585 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtlP38585 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtlP38585 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtlP38585 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TtlP38585 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtlP38585 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms