Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms