Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stfa3P35173 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stfa3P35173 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms