Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp4P35123 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp4P35123 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp4P35123 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp4P35123 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp4P35123 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms