Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms