Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kif5cP28738 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif5cP28738 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms