Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms