Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Etv4P28322 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Etv4P28322 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms