Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja4P28235 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja4P28235 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja4P28235 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja4P28235 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja4P28235 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms