Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms