Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3P27659 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms